根据2009年创新基金专家咨询委员会工作计划，为加强创新基金专家咨询委员对创新基金工作的指导，2009年5月中旬由黎懋明副主任委员率部分创新基金专家咨询委员赴陕西、福建两省考察调研，调研组共组织召开了四个座谈会，走访了16家创新基金支持过的科技型企业。调研的重点是：探索建立国家创新基金与地方创新基金高效互动的运行机制，进一步研究确定国家与地方创新基金定位，明确各自工作侧重点及目标，加强国家创新基金与地方创新基金运行机制的研究，形成国家创新基金与地方创新基金相互协作、互动的工作机制和体系；国家创新基金对地方区域经济促进作用的研究，研究国家创新基金对地方区域经济可持续发展，提升经济增长质量的促进作用。科技部计划司、创新基金管理中心有关领导一同参加了调研。

　　通过调研和座谈，专家们认为：国家创新基金与地方创新基金共同支持科技型中小企业技术创新活动形成了新的格局；创新基金重点支持的一大批高新技术企业及其项目促进了产业结构的调整，加快了高新技术产业发展的进程；创新基金培育了新的经济增长点，促进了经济增长和社会就业。

　　专家们建议：经过10年的摸索，创新基金无论从自身建设还是引导企业技术创新方面都取得较好的成绩。然而，未来，尤其是当前适逢严峻的全球金融风暴，创新基金的任务依然相当艰巨。为了更好地发挥创新基金的作用，在未来5年中继续引导企业的技术创新，推动地方区域经济的发展，国家应与地方形成合力，共同推动整个中小企业群体的发展。首先，国家创新基金与地方创新基金要确定各自的目标，使支持科技型中小企业的创新基金定位明确、操作性强，有利于政府、社会、企业对创新基金的有效使用。其次，根据中小企业的成长过程对国家创新基金的支持方式作适当调整和扩展。简化创新基金申报程序，重心下移，调整技术创新基金投资结构，建立综合评估机制。创新基金应结合不同地区、不同企业以及不同企业的发展阶段采取不同的支持，惟有这样，才能将有限的资金发挥更大的作用。